关于有效新生抗原的选择

癌症患者的T细胞通过包括突变氨基酸的HLA提示的新生抗原，有退去恶性肿瘤的效果。新生抗原将作为治疗标的物，或者说是标志物被运用到癌症治疗中，多数癌细胞基因突变是患者个体独有的变异，必须用个性化的方法提供治疗。众所周知，最新的检查方法可以更广泛的检索体细胞基因突变，但是现在的测序手段却很正确的选择被HLA提示的氨基酸突变。目前迫切需要解析的是如何选择新生抗原的肽链，HLA可以提示什么部位的突变才能诱导T细胞发挥强力的抗癌效果。

日本就医网协助日本免疫治疗机构，试用最前沿的新生抗原为中国肿瘤患者提供治疗，目前都采用为每位患者解析肿瘤标本后，由医生逐一挑取可能有效的新生抗原，这项体力+智力劳动，简直让医生挑花了眼。

最近我们发现，日本札幌医科大学病理学研究者金关贵幸等正在积极研究有效新生抗原的挑选方法，他们直接提取HLA的结合肽抗原，全面解读并确定了变形菌基因的解析方法。结合细胞特有的基因突变信息，可自然检验出HLA提示的新生抗原。先分析结直肠癌HLA-1提示的整体肽链目录，新生抗原所占的比例非常有限。推测被HLA提示的突变氨基酸相当于每个HLA烯丙基错义突变全体的0.1%，显示了新生抗原的稀缺性。

在基因突变较多的MSI型结直肠癌细胞中可以检测出多个新表位。其中一个为9-mer，在P8上有突变氨基酸(Asn>Lys)。用同样的肽链诱导CTL识别其中的1个氨基酸突变，CTL可以对该基因突变的结直肠癌细胞进行强力伤害。3D成像该肽链-HLA的复合体模型，观察到TCR的立体构造发生变化，我们认为它特异性地T细胞识别和抗原获取造成了突变的构造变化。

他们想通过变形菌基因组学的HLA配体解析，来获取HLA可提示的新生抗原。